對于陰離子色譜，通用有三種清洗方式，分別用于清洗酸溶性、堿溶性或有機污染物，在清洗過程中必須要確保嚴格按照清洗過程進行，否則會引起色譜柱的局部高壓而損壞色譜柱。對于有機溶劑清洗色譜柱，需要逐步減少有機溶劑的量以避免由于混合的流動相黏度的變化。
?。ㄒ唬┻x擇合適的清洗溶劑
1對低價親水污染物：用10倍的淋洗液；
2對高價親水污染物：用1~3mol/l的鹽酸做淋洗液；
3對金屬污染物：會引起色譜峰不對稱性，可采用絡合劑酸類，如0.2mol/l草酸；
4有機污染物：有機污染物會引起色譜柱效降低，可以采用兼容的有機溶劑清洗，有時也可以采用高濃度的鹽酸與有機溶劑混合清洗則更有效。
?。ǘ┣逑催^程
1配制500mL合適的清洗溶液；
2斷開抑制器中，分別清洗保護住和分離柱，如果分離柱和保護住串聯(lián)清洗，則將保護柱接在分離柱之后；
3設置流速對2mm色譜柱采用0.5ml/min，而對4mm色譜柱采用2ml/min；
4用二次去離子水沖洗色譜柱15min；
5用清洗液清洗色譜柱60min;
6用二次去離子水沖洗色譜柱15min；
7連接抑制器，用淋洗液平衡色譜柱。
（僅供參考）
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